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• アートボードの左上座標のpixel値を整数値にする（小数点以下がゼロになるようにする）
• スライスにする矩形の縦横を整数値にする。また左上の座標のpixel値も整数値にする。

上記で問題が解消されない場合、さらに

• 表示 > 定規 > アートボード定規に変更

を行う。（この情報がなかなか出てこない…）あとは

• スライス選択ツールで、ずれている部分を手動で直す。

ご参考までに。